Instytut posiada podpisane umowy o współpracy z Seinäjoki Unit of Ruralia Institute, University of Helsinki (FINLANDIA) oraz z Uniwersytetem w Kolonii (NIEMCY). Oprócz tego z wieloma ośrodkami i instytucjami zagranicznymi IRWiR PAN współpracuje bez zawartego porozumienia.

Pracownicy IRWiR PAN są aktywnymi członkami międzynarodowych organizacji naukowych np. prof. Katarzyna Zawalińska jest członkiem EAAE Board, dr Mirosław Drygas członkiem Executive Committe of the European Comission on Agriculture FAO, a dr Katarzyna Bańkowska delegatem Polski na posiedzenia grup roboczych OECD „Polityka Rolna i Rynek” oraz „Rolnictwo i Środowisko”.